Nevýhody zisku jakožto základního ukazatele používaného firmami jsou následující:
- zisk se nerovná přílivu peněz, náklady výdajům a výnosy příjmům
- zisk zahrnuje výsledky operací, které jsou mimořádné a do budoucna se nebudou opakovat
- různé metodiky zejména v oblasti:
- různé míry zdanění v různých zemích
- různé účetní standardy (české účetnictví, IFRS, US GAAP atd.) se mohou i významně lišit
- snadná manipulovatelnost zisku tak, aby zisk lépe vypadal (v angličtině je na to hezký pojem „window dressing“) – např. v oblasti různých metodik a jejich změn, zpoždění ve vystavování dokladů
Tyto skutečnosti činí zisk méně srovnatelný zejména mezi různými subjekty, ale také při srovnávání zisku v časové řadě.
Na zisk je proto dobré pohlížet v kontextu jiných ukazatelů jako je hrubá marže, celkové tržby, cash-flow, poměrové ukazatele finanční analýzy atd.